En la historia reciente, desde el año 2007 la División de Educación Rural, inspirado por el pensamiento del Pbro. Benjamín Núñez, de que la Universidad es un ente vivo, hemos llevado el aula universitaria a las comunidades rurales. Consecuentes con la Misión Histórica de nuestra casa de estudios, buscamos hacer vida la máxima de ser la Universidad Necesaria.
 
En ese recorrido hemos dado pasos por territorios rurales costarricenses y centroamericanos, trabajando en la construcción de procesos educativos más pertinentes y humanos, con mirada inclusiva y en respuesta a las necesidades que desde sus estos se derivan.

En este recorrido histórico, estos son los grupos que han pasado por la DER en esta historia reciente:

• 2007:  Grupo 33, Limón
• 2008:  Grupo 34, Corredores (Puntarenas)
• 2009:  Grupo 36, Coto Brus (Puntarenas)
• 2010:  Grupo 37, La Fortuna de San Carlos (Alajuela)
• 2011:  Grupos 38 y 39, Talamanca (Limón)
• 2011:  Grupo 40, Coto Brus (Puntarenas)
• 2012:  Grupo 01, Corredores (Puntarenas)
• 2013:  Grupos 02 – 03, Buenos Aires (Puntarenas)
• 2014:  Grupos 04 – 05, Valle La Estrella (Limón)
• 2015:  Grupos 06 – 07, Upala (Alajuela)
• 2016:  Grupo 08, Corredores (Puntarenas)
• 2017 y 2018:  Grupos 09 – 10 y 11, Sarapiquí (Heredia)
   

Asimismo, actualmente estas son las comunidades de aprendizaje en formación:

• 2018:  Grupos 12 – 13, Los Chiles (Alajuela)
• 2019:  Grupos 14 – 15, Lepanto (Puntarenas)
• 2019:  Grupos 16 – 17, Guatuso (Alajuela)
• 2021:  Grupo 18, Coto Brus (Puntarenas)
• 2022:  Grupos 19 y 20, La Cruz (Guanacaste)
• 2023:  Grupos 21 y 22, Upala, Alajuela
• 2024:  Grupos 23 y 24, Zona de Los Santos (San José)